skip to the content

Microbiologie

 

Biologie moleculara - diagnostic

Screening donatori de sange

Genetica si oncologie

Virusul Papilloma uman

Produse GMP de uz industrial

Virusologie

Timpul este critic atunci cand este vorba de detectia si identificarea infectiilor sistemice cauzate in cele mai multe cazuri de bacterii si fungi. Tratamentul eficient depinde de identificarea sursei de infectie si aplicarea rapida si eficienta a deciziilor terapeutice corespunzatoare.

Cresterea rezistentei microbiene la antibiotice, in comunitati umane si mai ales in stabilimentele de sanatate, a impus tragerea unui semnal de alarma la toate nivelurile – clinicieni, infectionisti, epidemiologi. Deoarece rezistenta microorganismelor la agentii terapeutici se asteapta sa creasca, se impune necesitatea folosirii unor produse de screening sigure, rapide si adecvate.

Roche Molecular Diagnostics ofera produse de testare microbiologica bazate pe tehnologia PCR, dupa cum urmeaza:

 

Truse pentru diagnostic

LightCycler® MRSA Advanced Test pentru detectia colonizarii nazale cu Staphylococcus aureus meticilino-rezistent (MRSA) este o determinare simpla, flexibila si fiabila, utila oricarei supravegheri moleculare a MRSA in cadrul programelor intraspitalicesti de control al infectiilor nozocomiale. LightCycler® MRSA Advanced Test este o determinare calitativa de diagnostic in vitro conceputa pentru instrumentul LightCycler® 2.0. Probele clinice sunt reprezentate de tampoane nazale din care se efectueaza extractia si liza mecanica de pregatire in vederea amplificarii si detectiei specifice a ADN MRSA. Testul nu este destinat diagnosticului infectiilor cu MRSA si nici ghidarii sau monitorizarii tratamentului specific. Se recomanda efectuarea concomitenta a culturilor celulare in vederea recuperarii microorganismelor pentru tipaj epidemiologic sau testarea sensibilitatii la antibiotice. Produsul se prezinta cu 2 componente, LightCycler® MRSA Advanced Test (96 teste) si LightCycler® Advanced Lysis Kit (96 teste). Reactivii din trusa sunt suficienti pentru 96 de reactii si sunt prezentati gata de utilizare. Rezultatele sunt disponibile in numai 2 ore, in serii de cate 30 de probe. Testul este validat cu 3 medii de transport al tampoanelor de recoltare. In comparatie cu cultura cromogena, sensibilitatea si specificitatea de diagnostic sunt mai mari de 96%.

LightCycler® SeptiFast Test MGRADE asigura detectia a 25 dintre cele mai obisnuite microorganisme asociate cu sepsisul, direct din 1,5 ml de sange, fara o incubare prealabila, in mai putin de 6 ore. Tratamentul eficient al sepsisului depinde de detectia timpurie si identificarea precisa a agentului patogen etiologic. Diagnosticarea prin metoda cultivarii este, din pacate, prea lenta pentru a putea fi folosita la instituirea precoce a tratamentului bolnavilor critici, cultura ramanand in multe cazuri negativa, deci nefolositoare. Detectia rapida prin metode moleculare poate ajuta la diagnosticarea rapida a bacteriemiei / fungiemiei si la administrarea antibioticoterapiei adecvate, reducand totodata utilizarea excesiva a antibioticelor de spectru larg.

Lista germenilor depistati si identificati cu LightCycler® SeptiFast Test MGRADE:

Gram (-)  Gram (+)  Fungi
 Escherichia coli  Staphylococcus aureus  Candida albicans
 Klebsiella pneumoniae/oxytoca  CoNS (stafilococi coagulazo-negativi)*  Candida tropicalis
 Serratia marcescens  Streptococcus pneumoniae  Candida parapsilosis
 Enterobacter cloacae/aerogenes  Streptococcus spp.**  Candida krusei
 Proteus mirabilis  Enterococcus faecium  Candida glabrata
 Pseudomonas aeruginosa  Enetrococcus faecalis  Aspergillus fumigatus
 Acinetobacter baumannii    * S. epidermidis, S. haemolyticus  
 Stenotrophomonas maltiphilia  ** S. pyogenes, S. agalactiae, S. mitis  
 

Reactivii si consumabilele de calitate MGRADE sunt special conceputi pentru detectia sensibila a acizilor nucleici bacterieni si fungici, evitand contaminantii ce pot sa interfere cu asemenea determinari. Sensibilitatea analitica este inalta prin tintirea unei regiuni repetitive ITS (Internal Transcribed Spacer).

Alte avantaje ale LightCycler® SeptiFast Test MGRADE:

  • Truse de pregatire a probelor adaptate diverselor optiuni de lucru: liza folosind instrumentul MagNA Lyser si extractia cu trusa SeptiFast Prep Kit.
  • Test conceput pentru instrumentul LightCycler® 2.0, pentru amplificare rapida si analiza curbelor de topire.
  • SeptiFast Identification Software (SIS), un program de consolidare a tuturor datelor intr-un singur raport dedicat fiecarui pacient.
  • Detectia optionala a genei mecA, la probele pozitive pentru Staphylococcus aureus, intr-o runda de lucru suplimentara cu trusa LightCycler® SeptiFast MecA Test MGRADE.

LightCycler® SeptiFast MecA Test MGRADE este destinat detectiei si identificarii ADN mecA in sange uman (recoltat pe K-EDTA). Testul se foloseste ca instrument ajutator pentru identificarea tulpinilor meticilino-rezistente de Staphylococcus aureus, iar rezultatele sunt folositoare coroborate cu prezentarea clinica, metodele standard de microbiologie si/sau alti markeri de laborator, la ingrijirea pacientilor suspecti de infectii sistemice cu MRSA. Testul se aplica acelor pacienti testati pozitiv pentru Staphylococcus aureus cu trusa LightCycler® SeptiFast Test MGRADE.

COBAS® TaqMan® MTB Test este un test de diagnostic in vitro de detectie calitativa a M. tuberculosis in probe clinice specifice. Testul utilizeaza tehnica PCR pentru amplificarea acizilor nucleici, urmata de hibridizare in vederea detectiei M. tuberculosis in probe respiratorii umane, lichefiate, decontaminate si concentrate, incluzand sputa expectorata sau indusa, precum si lavaje bronhio-alveolare (BAL). Spre deosebire de alte teste NAT mai laborioase, COBAS® TaqMan® MTB Test ofera pana la 48 teste pe seria de lucru si genereaza rezultate in numai 2,5 ore pe langa pregatirea probelor. Testul ruleaza exclusiv pe analizorul COBAS® TaqMan® 48 si include un control intern sistematic pentru cresterea controlului calitatii in laboratorul de analize.

Truse pentru cercetare

Aceste truse sunt concepute pentru instrumentul LightCycler® 2.0.

LightCycler® MRSA Detection Research Use Only Kit pentru detectia mec A (MRSA) a Staphylococcus spp. in probe de cercetare. Testul se poate combina cu LightCycler® Staphylococcus Research Use Only Kit MGRADE, permitand diferentierea ADN Staphylococcus aureus si a speciilor coagulazo-negative (CoNS) inainte de detectia genei mecA.

Maximul de veridicitate a trusei este asigurat de controlul intern (IC) ce identifica acele probe cu inhibitori de PCR. IC este astfel construit incat sa fie amplificat cu aceeasi pereche de primeri ca si tinta primara, dar este detectat intr-un canal de fluorescenta separat. Trusa contine reactivi suficienti pentru 56 de reactii, putand prelucra maxim 48 de probe. Componentele enzimatice, tampoanele si standardele sunt gata de utilizare.

Reactivii pentru extractie nu sunt inclusi in trusa. LightCycler® MRSA Research Use Only Detection Kit poate fi folosit impreuna cu High Pure PCR Template Preparation Kit (tastati codul 11796828001 in acest camp de cautare) sau cu trusa pentru sistem automat MagNA Pure LC Total Nucleic Acid Isolation Kit (tastati 03038505001). Extractia automata si instrumentul LightCycler® 2.0 genereaza rezultate complete in mai putin de 3 ore. O serie de lucru cu aceasta trusa se poate combina in aceeasi runda pe aparat cu trusa LightCycler® VRE Research Use Only Detection Kit, deoarece au profile termice identice, asigurand astfel maximul de flexibilitate de testare.

LightCycler® VRE Research Use Only Detection Kit este conceput pentru detectia genelor de rezistenta la vancomicina (vanA/vanB2/3) de Enterococcus spp. in probe de cercetare. Trusa este deosebit de reproductibila, incluzand un control intern in vederea identificarii probelor ce contin inhibitori ai procesului de amplificare. IC este astfel construit incat sa fie amplificat cu aceeasi pereche de primeri ca si tinta primara, dar sa fie detectat intr-un canal de fluorescenta separat. Componentele trusei, inclusiv standardele, sunt prezentate ca amestecuri si preparate gata de utilizare si permit analiza a 48 de probe (56 de reactii in total), incluzand si toti reactivii necesari prelucrarii controalelor.

Reactivii pentru extractia ADN nu sunt inclusi in trusa. Pentru extractia ADN, folositi procedeul manual cu High Pure PCR Template Preparation Kit sau procedeul automat cu sistemul MagNA Pure LC si trusa MagNA Pure LC Total Nucleic Acid Isolation Kit, mentionate anterior.

LightCycler® Staphylococcus Research Use Only Kit MGRADE este o trusa de PCR pentru detectia si diferentierea ADN S. aureus si CoNS in probe de cercetare. Trusa poate fi combinata cu LightCycler® MRSA Research Use Only Detection Kit in vederea detectarii genei de rezistenta la meticilina (mecA).

Toti reactivii din trusa sunt de calitate MGRADE menita pentru procedeele de mare sensibilitate de detectie a ADN bacterian si fungic. Produsele MGRADE sunt testate si sunt libere de orice contaminare bacteriana si fungica. Trusa contine reactivi suficienti pentru 48 de probe si poate fi folosita impreuna cu trusa MagNA Pure LC Microbiology Kit MGRADE in vederea prepararii probelor (accesati produsul tastand 03357961001 aici). 

Timpul total de lucru in flux automat cu instrumentele MagNA Pure LC si LightCycler® 2.0 este mai mic de 3 ore. Trusa incorporeaza un control intern pentru identificarea acelor probe ce contin inhibitori de PCR. LightCycler® Staphylococcus Research Use Only Kit MGRADE se executa sub un profil termic comun cu alte truse de cercetare microbiologica, astfel incat trusa poate fi combinata cu LightCycler® MRSA Research Use Only Detection Kit pentru testarea simultana a rezistentei, precum si cu trusele LightCycler® VRE Research Use Only Detection Kit, in aceeasi serie de lucru pe instrumentul LightCycler® 2.0. Trusa contine reactivii necesari pentru testarea a 48 de probe (8 serii de lucru a cate 6 probe fiecare).

Trusa este conceputa ca instrument de cercetare. Pot fi testate preparatele de ADN din flacoane de hemocultura, izolate de pe placile de cultura si preparate directe dintr-o gama larga de probe clinice (urina, tampoane, lavaj bronhio-alveolar, sputa).

Trusa S.E.T.S II este un sistem de eprubete (dispozitiv si solutii tampon) pentru extractia tampoanelor de recoltare si liza eficienta a materialului recoltat, numai pentru uz general de laborator si utilizare in vitro. Trusa S.E.T.S. II este conceputa pentru extractia rapida si in siguranta, prin centrifugare, a celulelor atasate sau a lichidului absorbit de tampoanele de recoltare, permitand extractia acizilor nucleici atunci cand este necesar. Avantajele trusei S.E.T.S. II sunt urmatoarele:

  • permite colectarea materialului aderent la tampoanele de recoltare printr-o centrifugare rapida, dar care nu trebuie sa depaseasca 14.000 rpm.
  • permite centrifugarea probelor in eprubeta inchisa, controland contaminarea
  • permite tratarea termica a materialului colectat, chiar in eprubeta de colectare
  • este potrivita pentru depozitarea probelor in eprubetele de colectare
  • suporta liza mecanica a materialului colectat in eprubeta colectoare, cu instrumentul MagNA Lyser
  • furnizeaza sistemul tampon pentru utilizarea directa in PCR sau in procedeele ulterioare de extractie a acizilor nucleici

 

(1) eprubeta interioara in care se va introduce  tamponul de dimensiuni standard (diametrul de aprox. 5-8 mm, lungimea 10-25 mm) in timpul centrifugarii.

(2) eprubeta colectoare folosita pentru colectarea si depozitarea lichidului extras din tampon.

(3) capacelul insurubat pentru inchiderea etansa a eprubetelor colectoare.

Stabilitatea S.E.T.S. avand tamponul de recoltare introdus in eprubeta interioara (1) nu este garantata la viteze mai mari de 14.000 rpm. Un pachet contine materiale pentru 100 de extractii (tampoanele de recoltare nu sunt incluse).

Solutia tampon S.T.A.R. Buffer este un tampon special pentru transportul materiilor fecale, ce contine un tampon de recuperare pentru stabilizarea probelor si recuperarea acizilor nucleici din probe pentru cercetare, compatibil cu sistemul de extractie MagNA Pure LC. Utilizarea S.T.A.R. Buffer asigura detectia sensibila a acizilor nucleici din probe de fecale prin legarea inhibitorilor, inactivarea nucleazelor si stabilizarea acizilor nucleici pe durata transportului la temperatura camerei.

S.T.A.R. Buffer este compatibil cu metodele de extractie manuale si automate, necesitand cloroform ca material aditional. S.T.A.R. Buffer este prezentat in 3 flacoane a 100 ml (dispozitivele de colectare si reactivii pentru extractie nu sunt inclusi). 

Instrumente